El principal rival del Flamurtari Vlorë es Tirana. Pero hoy en día, el apoyo al Flamurtari ha ido disminuyendo. Las próximas temporadas serían las peores para el equipo en los últimos 30 años, y el equipo tendría su mejor ubicación en la temporada 1998-99, camisetas barça finalizando en el puesto 11 en una liga de 16 equipos. Esto está relacionado con el hecho de que no ha habido otro equipo de fútbol en Vlorë.
